摘要: 为了快速发现与疾病关联的miRNA, 基于功能网络信息传播,提出PMBP算法用于改进随机游走法,使用留一交叉验证评估了算法性能,最后进行案例分析.实验结果表明:对于尚未发现关联miRNA的疾病,随机游走法是失效的,而PMBP以疾病相似性作为先验信息,能够有效预测;对于已经关联miRNA的疾病,PMBP提高了预测性能,AUC值为0.866.对乳腺癌进行案例分析,预测的前50个miRNAs都被证实与乳腺癌相关,体现了PMBP算法的有效性.
中图分类号:
李建华, 雒士源, 张建营, 康雁. 基于功能网络信息传播预测疾病-miRNAs的关联[J]. 东北大学学报:自然科学版, 2018, 39(3): 325-329.
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